Sechs Monate, nachdem Mr. Hopp der kleinen Ruby während der Ereignisse von Mr. Hopp's Playhouse alles weggenommen hat, ist er zurückgekommen, um mehr zu erfahren.

Nach einer engen Begegnung landet Ruby in der Unterwelt, einem Reich, in dem verlorene Seelen ewig durch die Dunkelheit streifen. Sie trifft auf ein anderes menschliches Mädchen namens Esther und gemeinsam müssen sie Rätsel lösen, Fallen vermeiden und höllische Feinde besiegen, um die Sechs Medaillons zu finden und der Herrschaft der Entität ein für alle Mal ein Ende zu bereiten.

Renne und verstecke dich vor den Spielzeugen, die zu Monstern werden; Mr. Hopp, der haarsträubende Hase, Mr. Stripes, der furchterregende Tiger, und Miss Bo, der Panik auslösende Panda. Kämpfe gegen riesige Bosse, die dich überragen, hilf Ruby, ihre verlorenen Eltern zu finden und entwirre Esthers beunruhigende Vergangenheit.

Mr. Hopp's Playhouse 3 ist ein Abenteuerspiel mit leichten Kampfelementen und einer Vielzahl von Rätseln, die es zu lösen gilt, um voranzukommen, mit einem Grafikstil, der von der frühen Ära der 3D-Spiele auf PS1 und N64 inspiriert ist.