Das Hauptziel von Helix Jump ist es, einen springenden Ball durch ein spiralförmiges Turmlabyrinth zu führen und den Boden zu erreichen.
Die Spieler steuern die Richtung des Balls, indem sie auf dem Bildschirm nach links oder rechts wischen. Es gibt keine weiteren Bedienelemente, was das Erlernen und Spielen erleichtert.
Der Turm besteht aus verschiedenfarbigen Plattformen, und der Spieler muss den Ball durch Lücken in diesen Plattformen navigieren. Wenn der Ball auf eine Plattform trifft, zerbricht er und der Spieler hüpft weiter nach unten.
Punkte werden verdient, wenn sich der Ball durch das Labyrinth bewegt. Das Zerbrechen mehrerer Plattformen in einem einzigen Sturz oder die Landung auf speziellen Plattformen kann die Punktzahl erhöhen.
Helix Jump bietet endloses Gameplay, was bedeutet, dass es kein ultimatives Ziel oder Endlevel gibt. Die Spieler spielen weiter und versuchen, ihren eigenen Highscore zu schlagen.